一般查的是從標題開始到參考文獻之前的所有內容。

正文部分是主要查重的部分，是最為重要的，然后論文致謝、關鍵詞、附錄和致謝部分一般也都需要查重。

PaperPP論文查重系統查的內容大致如上所示，而進行論文查重的直接目的就是為了檢測出論文的重復率，從論文重復率是能夠判定出論文中存在的學術不端行為嚴重程度的。論文重復率越高，就說明學術不端行為越嚴重，各個高校都會規定畢業生論文重復率的合格標準，學歷越高，其合格標準越嚴格。